H Εκκλησία της Παναγίας Φλαμπουριανής αποτελεί ένα σημαντικό εκκλησιαστικό μνημείο στην Κύθνο. Χτισμένη στην άκρη ενός βράχου, διαιρώντας την ομώνυμη παραλία, πιστεύεται πως τα ίχνη που οδηγούν από την παραλία έως την εκκλησία είναι τα ίδια που άφησε η Παναγία. H εκκλησία βρίσκεται κοντά στην Παλιά Φλαμπουριά, η οποία απέχει λίγο πάνω από 11 χιλιόμετρα από τη Χώρα της Κύθνου.
H παράδοση θέλει την ίδρυση της εκκλησίας στα μέσα του 17ου αιώνα. Ο ναός είναι βυζαντινού ρυθμού και ο θρύλος τη συνδέει με τις άλλες δύο σημαντικές εκκλησίες του νησιού, την Παναγία την Κανάλα και τη Στρατηλάτισσα, έτσι ώστε να αποτελούν έναν ενιαίο θρησκευτικό τόπο. H Εκκλησία γιορτάζει στις 23 Αυγούστου, κατά τη διάρκεια του οκταημέρου της Παναγίας, με πλήθος κόσμου που συγκεντρώνεται για ένα μεγάλο πανηγύρι.
