Αρχαιολογικοί χώροι | Ακρωτήρι: η Πομπηία του Αιγαίου. Είναι ένας από τους σημαντικότερους προϊστορικούς οικισμούς του Αιγαίου και αρχαιολογικός χώρος με παγκόσμια ακτινοβολία. Η αρχική εγκατάσταση στο Ακρωτήρι χρονολογήθηκε στην 4η χιλιετία π.Χ. Ο οικισμός που υπήρξε την 3η χιλιετία π.Χ., μεταξύ 20ου -17ου αι. π.Χ., εξελίχθηκε σε σημαντικό κέντρο του Αιγαίου έχοντας σχέσεις με τη Μινωική Κρήτη, την Αίγυπτο, τη Συρία. Το τελευταίο τέταρτο του 17ου π.Χ. αι., οι κάτοικοι εγκατέλειψαν την πόλη λόγω ισχυρών σεισμών. Με την έκρηξη του ηφαιστείου που ακολούθησε, τα ηφαιστειακά υλικά κάλυψαν τον οικισμό και έτσι διατηρήθηκε στη διάρκεια των αιώνων. Χάρη στις συστηματικές ανασκαφές στο Ακρωτήρι που άρχισαν το 1967 από τον καθηγητή Σπύρο Μαρινάτο και την Εν Αθήναις Αρχαιολογική Εταιρεία, η προϊστορική πόλη ήρθε σιγά σιγά στο φως. Μετά το θάνατό του, το 1974, τα ηνία πήρε ο καθηγητής Χρίστος Ντούμας. Ο αρχαιολογικός χώρος, που καλύπτεται από ένα σύγχρονο βιοκλιματικό στέγαστρο, είναι πολύ οργανωμένος και εντυπωσιακός.
Η αρχαία Θήρα: Η πιο σημαντική πόλη της Θήρας των ιστορικών χρόνων βρίσκεται στο Μέσα Βουνό και προσφέρει φανταστική θέα προς το Καμάρι (βλ. παραλίες για ολα), τον Περίβολο, την Περίσσα και το πέλαγος. Ιδρύθηκε αρχικά τον 9ο αιώνα π.Χ. από Δωριείς εποίκους με αρχηγό τον Θήρα και κατοικήθηκε μέχρι τους πρώιμους βυζαντινούς χρόνους. Με τις ανασκαφές αποκαλύφθηκε η ελληνιστική και ρωμαϊκή φάση. Μεταξύ των μνημείων που θα δείτε στον αρχαιολογικό χώρο είναι η Αγορά, η Βασιλική στοά του 1ου αι. π.Χ., ο ναός του Διονύσου του 3ου αι. π.Χ., η περιοχή των ιερών, το γυμνάσιο εφήβων του 2ου αι. π.Χ., τα νεκροταφεία στις πλαγιές της Σελλάδας και το θέατρο (3ος αι. π.Χ.).
Μουσεία | Μουσείo Προϊστορικής Θήρας, στα Φηρά: Εξαιρετικό μουσείο που εκτείνεται σε 600 τ.μ., χωρίζεται σε 4 ενότητες και έχει σύγχρονο σχεδιασμό. Εκτίθενται ευρήματα από την ανασκαφή στο Ακρωτήρι και άλλες θέσεις της Θήρας που χρονολογούνται από την 4η χιλιετία π.Χ. μέχρι το 17ο αι. π.Χ. | Αρχαιολογικό μουσείο, στα Φηρά: Στεγάζει ευρήματα από την ανασκαφή της αρχαίας Θήρας. Περιλαμβάνει γλυπτά και επιγραφές από την αρχαϊκή μέχρι και τη ρωμαϊκή εποχή, κεραμικά και πήλινα ειδώλια από τη γεωμετρική μέχρι την ελληνιστική εποχή. | Ναυτικό Μουσείο Οίας: Στεγάζεται σε καπετανόσπιτο και περιλαμβάνει εκθέματα σχετικά με τη ναυτική ιστορία του οικισμού. | Lost Atlantis Experience, στο Μεγαλοχώρι: Μοντέρνο διαδραστικό μουσείο 700 τ.μ. Με τη χρήση καινοτόμου τεχνολογίας «αφηγείται» το ιστορικό χρονικό του ενεργού ηφαιστείου της Σαντορίνης και του μοναδικού της πολιτισμού. Μεταξύ άλλων θα δείτε ολογραφικές αναπαραστάσεις της γεωγραφικής εξέλιξης του νησιού και θα βιώσετε τον μεγάλο σεισμό. | Βιομηχανικό μουσείο τομάτας Δ. Νομικός, στη Βλυχάδα: Το παλιό τοματοποιείο με το χαρακτηριστικό φουγάρο έχει γίνει ένα εξαιρετικό μουσείο τομάτας. Στο συγκρότημα κτιρίων φιλοξενείται και το Εργοστάσιο Τεχνών Σαντορίνης (SAF) με πλούσια πολιτιστική δράση.