Ενα μάλλον άγνωστο στον πολύ κόσμο σπήλαιο, με ιδιαίτερα ταραγμένη ιστορία. Βρίσκεται περίπου 3 χιλιόμετρα από το χωριό Μίλατος, σε υψόμετρο 155 μέτρων. Η τραγική ιστορία που το ακολουθεί σχετίζεται με τα γεγονότα του Φεβρουαρίου του 1823, όταν οι κάτοικοι της περιοχής κλείστηκαν σε αυτό για να γλιτώσουν το κυνηγητό από τους Τούρκους.
Μετά από πολιορκία αρκετών ημερών οι κάτοικοι αναγκάστηκαν να βγουν, με αποτέλεσμα να υπάρξουν εκτεταμένες σφαγές αλλά και βασανιστήρια στα γυναικόπαιδα. Προς τιμήν των αδικοχαμένων συμπατριωτών τους, οι Κρητικοί έφτιαξαν στο εσωτερικό της σπηλιάς το παρεκκλήσι του Αγίου Θωμά.
Το σπήλαιο έχει σχετικά εύκολη πρόσβαση μετά από ένα σύντομο μονοπάτι και πέρα από την πολύ όμορφη εικόνα με το εκκλησάκι παρουσιάζει και ιδιαίτερα μεγάλο γεωλογικό ενδιαφέρον, διαθέτοντας εντυπωσιακούς σχηματισμούς από σταλαγμίτες.
