Είναι επίσης γνωστή ως Ναός της Παναγίας Τριμάρτυρης, αποτελεί έναν σημαντικό ναό στην πόλη των Χανίων. H κατασκευή του σημερινού ναού έγινε στον χώρο ενός παλιού ενετικού της Παναγίας και ολοκληρώθηκε το 1860. Λέγεται «Τριμάρτυρη» γιατί, ενώ το κεντρικό κλίτος είναι αφιερωμένο στην Παναγία, το βόρειο είναι αφιερωμένο στον Άγιο Νικόλαο και το νότιο στους τρεις Ιεράρχες.
Οι τοίχοι του ναού είναι διακοσμημένοι με εντυπωσιακές αγιογραφίες και περιλαμβάνουν εικόνες των Εισοδίων της Θεοτόκου και άλλων θρησκευτικών σκηνών που φιλοτέχνησαν διάσημοι ζωγράφοι. Ο ναός υπέστη σοβαρές ζημιές κατά τους βομβαρδισμούς της πόλης από τους Γερμανούς τον Μάιο του 1941, αλλά ανακατασκευάστηκε στη συνέχεια. H εκκλησία γιορτάζει στις 21 Νοεμβρίου.